Doel van het dispuut is het bieden van een positief-christelijke reflectie op wat de studenten aan de Groninger faculteit en de PThU krijgen aangereikt. Bonifatius voelt zich verwant met zowel de reformatorische disputen Voetius en Synopsis als met de meer evangelicale Themelios en To the Point.

Opvallend is volgens de faculteit dat dispuutleden tegelijk lid kunnen zijn van een algemene christelijke vereniging zoals CSFR of Navigators. De oprichting is bespoedigd door het besluit van de PThU om haar opleidingen te verplaatsen naar Groningen en Amsterdam.